El caso más habitual en el que se lleva a cabo una endodoncia es la aparición de dolor por afectación del nervio. Habitualmente está íntimamente relacionado con las caries en el preciso momento de alcanzar el nervio.

Con la endodoncia se limpia el interior del diente haciendo desaparecer cualquier atisbo de infección. Con el diente limpio se puede proceder en condiciones a la restauración del mismo, de ser necesario.

Existen otros casos en el que no hay aparición de dolor, sin embargo se requiere una endodoncia preventiva o en otros casos especiales.